PCR實驗室又叫基因擴增實驗室。是一種分子生物學技術。PCR實驗室可分為四個單獨區域：試劑貯存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物配制和擴增區、擴增產物分析區。

PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，為避免各實驗區域間交叉污染，進入各個工作區域須遵循單方向進行，即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。

PCR試劑貯存和準備區

試劑和用于樣品制作的材料應直接運送至該區，不得經過其他區域。試劑原材料必須貯存在本區內，并在本區內制備成所需的貯存試劑。
PCR標本制備區
該區域主要進行樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入至擴增反應管和測定DNA的合成。
本區的壓力梯度要求為：鄰近區域為正壓，避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。由于在加樣操作中可能會發生氣溶膠所致的污染，所以應避免在本區內不必要的走動。

擴增反應混合物配制和擴增區

已制備的DNA模板 (來自樣本制備區)的加入和主反應混合液(來自試劑貯存和制備區)制備成反應混合液等也可在本區內進行。
本區的壓力梯度要求為：鄰近區域為負壓，以避免氣溶膠從本區漏出。為避免氣溶膠所致的污染，應盡量減少在本區內的不必要的走動。個別操作如加樣等應在超凈臺內進行。

擴增產物分析區

本區是最主要的擴增產物污染來源，因此對本區的壓力梯度的要求為：相對于鄰近區域為負壓，以避免擴增產物從本區擴散至其它區域。

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