保稅區的功能十分強大，進一步說保稅區的功能跟香港的功能一樣，但是唯一的區別就是保稅區是在中國境內的區域，它是由海關監管的區域。
貨物從國內進入保稅區視同出口，保稅區回到國內視同進口。
貨物從香港直接可以刷卡進入深圳保稅區無需辦理進口貨物手續。
深圳出口加工區 不僅具有保稅區的功能而且還有深加工的功能，專業為出口企業提供一個很好的售后服務平臺，假如出口到國外的貨物，出現不良品需要返回國內維修深加工，坪山出口加工區則是最佳的選擇。

坪山出口加工區 借助海關在深圳設立的檢測維修中心進行售后維修：
不需要辦理復雜的退運手續，只需要裝箱單、形式發票跟海關申報，不用原始單證；
無需向海關申請退運貨物協議, 免中檢，無需交納保證金方案。

流程：工廠將貨物經香港碼頭送進檢測維修保稅區倉庫（或者從鹽田碼頭轉關入區），廠方安排技術人員和配件以及檢測儀器到倉庫維修，改換包裝，改換完畢后裝柜直送香港碼頭或轉關鹽田碼頭出口。
相比傳統處理退運方式，優劣勢分析：
(1)無須辦理復雜的退運手續，無需向海關申請退運貨物, 無需交納保證金。
(2) 復雜問題簡單化, 節約時間、成本. 特別從香港碼頭提貨到檢測保稅區（進區僅需打EDI單）只需3小時。

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